서울과학고등학교의 입시 일정이 코로나19 사태로 입시일정이 변경됐다. 이번 입시 일정 연기는 17일 전국 학교의 학사 일정의 변경에 따른 것이다. 

서울과고는 18일 학교 홈페이지의 공지에서 원서접수기간을 2020년 4월 7일~10일까지에서 4월 21일(화)~4월 24일로 변경했음을 알렸다. 아울러 서류제출도 이 기간에 제출해야 한다.

1단계 전형도 4월 20일(월)~5월 4일(월)에서 5월 1일(월)에서 5월 18일(월)로 변경됐으며, 2단계 전형 대상자 발표일은 2020년 5월 8일(금) 17:00에서 2020년 5월 22일(금) 17:00시 2주일 연기됐다.

2단계 전형일은 2020년 5월 17일(일)에서 5월 31일(일)로 변경됐으며, 3단계 전형 대상자 발표일 역시 7월 17일에서 7월 24일(금) 17:00시로 변경됐다.

3단계 전형은 7월 25일(토)~7월 26일(일)에서 8월 1일(통)~8월 2일(일)로 변경됐다. 합격예정자 발표는 2020년 8월 7일(금) 17:00에서 8월 14일(금)으로 1주일 연기됐다.

최종 합격자 발표는 2020년 11월 27일(금)에서 2020년 12월 4일(금)으로 변경됐다.